Specjalne umiejętności można zakupić za PU (punkty umiejętności). Pomagają one w grze i "uzdalniają" postać.

Specjalizacja w Doton (10pu) - każde jutsu z żywiołu ziemi jest liczone tak, jakby twoja cecha ninjutsu była 1.5 razy większa.

Specjalizacja w Fuuton (10pu) - każde jutsu z żywiołu powietrza jest liczone tak, jakby twoja cecha ninjutsu była 1.5 razy większa.

Specjalizacja w Katon (10pu) - każde jutsu z żywiołu ognia jest liczone tak, jakby twoja cecha ninjutsu była 1.5 razy większa.

Specjalizacja w Raiton (10pu) - każde jutsu z żywiołu prądu jest liczone tak, jakby twoja cecha ninjutsu była 1.5 razy większa.

Specjalizacja w Suiton (10pu) - każde jutsu z żywiołu wody jest liczone tak, jakby twoja cecha ninjutsu była 1.5 razy większa.

Robienie jutsu jedną ręką (20pu) - do jutsu wystarcza ci jedna ręka, przy czym w drugiej możesz trzymać np. miecz.

Walka dwoma brońmi naraz (30pu) - potrafisz walczyć dwoma brońmi bezpośredimi (jak np. miecz, nunchako) trzymając je w obu rękach. Jedyny minus jest tutaj taki, że aby zrobić jutsu, musisz upuścić choć jeden miecz.

Szybkie rzucanie (50pu) - rzucasz z  oszałamiającą prędkością. Potrafisz w jednej turze rzucić nawet 4 brońmi  (4 rzuty).

Podwójne jutsu (100pu) - w jednej turze możesz użyć nawet dwóch jutsu.